미래개혁특별위원회는 특정 분과위원회에 속하지 않는 업무, 2주기 대학평가 관련 업무, 그외 회장이 위촉한 업무를 다루며, 임원회 회의와 운영위원회 회의에서 제안 또는 발의한다.